核酸雜交試劑耗材

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Northern blotting 試劑盒(含地高辛探針)
作者:Exon02 發(fā)布于:2021/2/15 12:12:43 點(diǎn)擊量:

Northern blotting 試劑盒(含地高辛探針)

一、試劑盒組成:

(1)   地高辛標(biāo)記的目的探針  25T

(2)   樣品預(yù)處理液

(3)   甲醛變性電泳上樣緩沖液

(4)   10XMOPS溶液、洗滌膠溶液、RNA水解液

(5)   轉(zhuǎn)膜液

(6)   雜交液

(7)   洗滌液I、洗滌液II

(8)   NBT/BCIP顯色底物

(9)   NBT/BCIP顯色緩沖液

試劑盒:25T

保存:2-8

貨號:R2550

二、核酸樣本準(zhǔn)備與電泳:

Northern blotting檢測單一基因RNA表達(dá)變化首選方法,核酸電泳是變性條件下進(jìn)行以除RNA二級結(jié)構(gòu)。本試劑盒主要通過甲醛變性。然后將RNA轉(zhuǎn)移到帶正電荷的尼龍膜,再與地高辛探針雜交。

三、探針的獲得:

Northern探針可以用PCR標(biāo)記,隨機(jī)引物標(biāo)記,T7/SP6轉(zhuǎn)錄特異性RNA標(biāo)記,末端轉(zhuǎn)移酶法,DIG寡核苷酸末端標(biāo)記,缺口翻譯進(jìn)行DIG標(biāo)記,cDNA合成,外顯子生物均可提供上述地高辛探針標(biāo)記(約2000元,至少滿足20次)。使用探針濃度約10-15ng/ml,探針長度變大,導(dǎo)致使用量變大。本試劑盒提供的探針是客戶定制的地高辛標(biāo)記RNA探針。

四、結(jié)果顯色說明:

可以采用堿性磷酸酶底物NBTBCIP,抗-地高辛過氧化物酶與NBT/BCIP反應(yīng)。用于X底片顯色。也可以選擇其他顯色方法。

五、實(shí)驗(yàn)操作步驟:

1RNA電泳樣品準(zhǔn)備:為防止RNA降解,請?jiān)诒喜僮鳎?span>10-20ug2-4ul)的RNA樣品預(yù)處理液1:8體積混合,加熱8510分鐘,加入2ul甲醛變性電泳上樣緩沖液混合,冰上待用。

2)配膠:1.5%的瓊脂糖可以分離0.5kb-1.5kb左右片段。稱量1.5g瓊脂糖加80ml純水,煮沸,冷卻到55℃左右(不燙手),加入10ml 10XMOPS20ml去離子甲醛溶液,室溫放置1小時。

3)在5V/cm電壓下,預(yù)電泳5分鐘,加入樣品和RNA Marker,電泳需要至少4小時,每隔1小時更換1X MOPS電泳緩沖液一次。

4)將瓊脂糖膠放在保鮮膜內(nèi),紫外燈下計(jì)算作圖并標(biāo)記,評估分子量的位置。

5)在室溫下將凝膠浸入洗滌膠溶液20分鐘,輕輕搖動。用RNA水解液浸泡凝膠20分鐘,立即轉(zhuǎn)膜。

5)轉(zhuǎn)模:按照下圖制作轉(zhuǎn)膜系統(tǒng),利用試劑盒提供的轉(zhuǎn)膜液通過毛細(xì)管轉(zhuǎn)移到膜上,從凝膠吸取RNA到尼龍膜過夜,以確保RNA有效轉(zhuǎn)移。

  轉(zhuǎn)模圖(略)                                

6)轉(zhuǎn)模后,使用 UV交聯(lián)濕膜,無需清洗。UV交聯(lián)后,用H2O短暫沖洗膜,然后使其風(fēng)干;蛟120°C下烘烤,30分鐘?梢杂脕喖姿{(lán)溶液鑒定RNA的豐度。

7)預(yù)雜交和雜交:將印跡膜放在包含20 ml預(yù)雜交溶液的雜交袋中,密封袋子,預(yù)雜交溫度下預(yù)雜交2小時。探針濃度10–20ng/ml,DIG標(biāo)記探針,雙鏈DNA探針,在沸水浴中加熱10分鐘使DNA變性,在冰上冷卻。單鏈RNA探針和寡核苷酸探針在稀釋前不需變性。準(zhǔn)備至少3.5 ml雜交溶液,以滿足10x10 cm的印跡。用雜交溶液稀釋探針。丟棄袋子內(nèi)預(yù)雜交溶液,添加包含DIG標(biāo)記探針的雜交溶液。42℃條件下均勻搖動雜交15-18小時。

8)洗滌:在室溫下,將膜在洗滌液I中洗滌兩次,每次5分鐘,除去未結(jié)合的探針。在洗滌液II中清洗膜兩次,每次清洗15分鐘。

9)雜交后洗滌,將膜在洗滌液I中平衡1分鐘。在封閉溶液中輕輕攪動薄膜30-60分鐘,封閉薄膜。

10)地高辛二抗孵育:稀釋抗高辛抗體,將3 µl Anti-Digoxigenin-AP添加到30 ml封閉液中并混合。在抗體溶液中將膜孵育30分鐘。棄抗體溶液,在洗滌液I中輕輕洗膜兩次,每次洗滌15分鐘。

10)曝光檢測信號:棄洗滌液,在NBT/BCIP緩沖液中平衡膜2分鐘。配置NBT/BCIP顯色液,常規(guī)方法顯色,NBT/BCIP一般2分鐘-12小時內(nèi)。





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